完成对刘璋的讨伐并占领成都后，游戏剧情将进入平定西南和筹备北伐的新阶段，玩家的主要任务方向是稳固新占领的西蜀地域，并逐步向北方曹魏势力控制的区域推进。在彻底击败刘璋后，刘备阵营正式拥有稳固的根据地，接下来的目标自然转向外部的扩张与征伐。此阶段的任务逻辑紧密承接三国历史脉络，从巩固益州到谋划进攻汉中乃至中原，构成了一个完整的战略篇章。游戏会通过一系列新的城池、关卡和剧情战斗来引导玩家体验这一过程，其中包含了探索新地点、触发关键剧情对话、击败守军以及招募在后续故事中登场的将领等一系列连贯任务。
玩家需要离开成都，前往北方的汉中地区继续作战。在进军途中，首要目标是攻取涪水关、绵竹关等一系列战略要地，这些关卡均有敌军将领把守，必须通过战斗来突破。在此过程中，探索变得尤为重要，一些强大的装备如白虎斧、青龙刀和青龙甲会隐藏在新的山洞或特定城池角落中，仔细搜索这些地点能为队伍带来显著的战力提升。在汉中城及之后蒋琬所在的村庄里，都有机会找到强力的白虎斧。部分原先无法路径，需要从特定人物处获得或使用关键道具才能开启，例如在攻打巴关时，与特定小兵对话可以避免中计，从而更简单地通过。
此阶段会经历数个重要的剧情事件，其中落凤坡事件是关键的转折点，军师庞统在此处会因剧情安排而离队。玩家需要一路撤退至涪水城，并在那里迎来诸葛亮和关羽、赵云的支援，与张任进行一场复仇之战，这场战斗有剧情火焰辅助，难度相对较低。此后，队伍将继续进军，攻克巴城、建宁城等地，并在过程中收服诸如严颜、雷同、蒋琬、吴懿等蜀地将领，虽然其中部分将领的实战能力有限，但丰富了队伍的编成选择。在推进至金雁桥时，将会触发与张任的单挑剧情，为其害死庞统的剧情做个了结。这一连串的任务构成了一个完整的复仇与平叛叙事链。
在彻底平定西川内部后，游戏的终极目标指向北方的曹魏。任务主线会引导玩家为北伐中原做准备，这意味着需要进一步提升队伍等级、更新最强装备、并调整最终的武将阵容。后续的剧情将会跨越西蜀地域，进入以汉中为起点的新地图，与司马懿、曹操等势力展开最终的对决。部分强力武将和终极装备的获取条件也在这个阶段达成，整个游戏的策略重心从攻城略地转向为最终决战进行全方位的筹备，包括阵型的优化、军师计策的选择以及核心成员的最后定型。
